结构生物学:从原子到生命.pdf

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书籍描述

编辑推荐
《结构生物学:从原子到生命》由利尔加斯编著,覆盖了蛋白质、核酸、脂类及膜领域的基础知识,包含了很多隐含在原始文献中但对于结构生物学相关领域的工作者非常重要的观察事实。对于需要复习基础化学知识的学生,我们推荐先读一读相关附录。附录中还包含了一些利用蛋白质序列及结构相关数据库的必需工具,以及一个简短的蛋白质及结构生物学相关的诺贝尔奖得主的介绍。《结构生物学:从原子到生命》并不试图描述得到结果的方法,这需要不同的出版物共同完成。然而,这本内容有限的教科书向我们综合地描述了蛋白质、核酸、脂类及生物膜的结构与功能。很遗憾没能包括多糖生物学,生物学中多糖材料的复杂性超过了《结构生物学:从原子到生命》描述的任何其他类分子,因而需要更多的空间。况且,目前多糖系统的结构知识还是相当有限的。

名人推荐
这是一本近年来出版的非常优秀的结构生物学教科书,由六位结构生物学领域国际知名科学家合作撰写。它以生物学功能为主线,以生物大分子及其复合物的三维原子结构为中心,深刻解析重要生命活动的结构基础和分子机理,内容涵盖从蛋白质、核酸、脂类到生物膜,从遗传到蛋白质产生与消亡,从信号转导、细胞运动与相互作用和演化到免疫系统和病毒结构与功能,系统深入,内容丰富翔实,图文并茂,整合了迄今最新的研究成果和学科知识,展现了从生物大分子的原子结构到重要生命活动的内在联系和基本原理。结构生物学作为一门交叉学科自20世纪90年代诞生以来,研究内容和影响日益扩大,学科内涵日臻清晰,该书及结构生物学领域近年来其他专著和教科书的不断出版,标志着结构生物学已经成为一门独立成熟的学科,正推动人们对生命现象的认识深入到以生物大分子精确三维结构为基础的新层次。
——王大成,中国科学院院士,研究员,中国科学院生物物理研究所
该书详细系统地介绍了现代生物学的一个重要分支——结构生物学,书中许多内容描述得丰富多彩、深入浅出,例如对于G蛋白结构机理及相关领域介绍的章节在其他专著中是较难看到的。总体来说,这是一本不可多得的生物大分子结构与功能百科全书式的综述专著。
——丁建平,研究员,中国科学院上海生命科学研究员生物化学与细胞生物生物学研究所
该书图文并茂、全面系统,是结构生物学领域近年出版的优秀专著及教科书之一,它对于结构生物学的入门者及资深科学家都具有很好的学习及参考价值。
——许瑞明,研究员,首批“千人计划”学者,中国科学院生物物理研究所
非常高兴看到《结构生物学——从原子到生命》的出版,这对于促进结构生物学在我国的快速发展非常及时。该书的作者大都是结构生物学领域的具有国际水平的专家,他们能够抽出时间和精力编写这样一本雅俗共赏、通俗易懂的专著式教科书,实属难能可贵。
——施一公,教授,首批“千人计划”学者,清华大学医学院和生命科学学院

作者简介
作者:(瑞典)利尔加斯(Anders Liljas) (瑞典)Lara Liljas Jure Piskur (瑞典)Poul Nissen 等 译者:苏晓东 等

目录
中译本序
译者序及致谢
前言
第一章 导论
第二章 蛋白质结构基础
第三章 核酸结构基础
第四章 脂类及膜结构基础
第五章 酶
第六章 DNA代谢——复制与重组
第七章 转录
第八章 蛋白质的合成——翻译
第九章 蛋白质的折叠与降解
第十章 膜蛋白
第十一章 信号转导
第十二章 细胞的运动及物质运输
第十三章 细胞间相互作用的结构基础
第十四章 免疫系统
第十五章 病毒的结构与功能
第十六章 结构生物学和生物大分子的演化
附录A 大分子的化学键及能量关系
附录B 折叠类型的比较方法
附录C 蛋白质构象的预测
附录D 蛋白质功能的确认
附录E 蛋白质的修饰
附录F 与结构生物学相关的诺贝尔奖得主
索引

文摘
版权页:

结构生物学:从原子到生命

插图:

结构生物学:从原子到生命

结构生物学:从原子到生命

3.4.11.2 P4—P6
Tetrahymena组Ⅰ内含子mRNA(1GID)中含有160个核苷酸的P4—P6域的分辨率为2.8A的晶体结构提供了一些RNA折叠模体更加细致的信息,也给出了关于前面章节中讨论的RNA结构基本原理的一些例证。
组Ⅰ的自剪切内含子催化它们从一个前体mRNA的自我切除。组Ⅰ内含子可以被归类为核糖酶。Tetrahymena组Ⅰ内含子的催化核心包含两个主要的域,催化位点就位于它们之间。因此,P4—P6结构域只包含一半的活性位点,所以它自身没有催化活性。
图3.62显示了P4—P6的结构,包括碱基对片段P4、P5和P6,以及链接区域J3/4、J4/5和J5/6。P4—P6也会含有一个延伸的部分,即P5abc(P5a、P5b和P5c),其只在组Ⅰ内含子的一个亚类中被找到,但是它一旦出现,对于催化活性是非常重要的。
在P4—P6结构中,有两个螺旋区域,肩并肩排列,占主导地位(图3.63)。通过同轴堆积,螺旋P6b、P6a、P6、P4和P3在分子的一侧形成了一个直的圆柱体(保守核心),而延伸的部分P5abc形成了一个香蕉状的支持部分。
两个重要的空间相互作用形成了一个在延伸片段和保守核心之间的界面。其中之一是在P4螺旋的浅沟和富含A的凸起的碱基之间的相互作用。另一种相互作用来自P5abc片段尖端的GAAA四环和保守核心的四环受体,其位于螺旋P6a和P6b之间的内环上(J6a/6b)。
在晶体结构中,富含A的凸起形成了一个转向,其中的A碱基都被倒置于外面。凸起的4个A碱基与堆积相互作用和氢键的形成都有关,是分子中两个螺旋堆积的有效桥梁。为了稳定富含A的凸起的紧急转向,两个镁离子直接与环上的磷酸氧形成了配位键。在凸起中,最前面的两个A碱基结合到了螺旋P4的深沟上,而最后两个碱基则结合到了延伸片段三茎连接的口袋中。
对于富含A的凸起在稳定P4—P6结构域三维结构重要性方面的观察,很好地与定点突变和化学保护实验相吻合,这也强调了整个结构对于凸起上的突变非常敏感。

内容简介
《结构生物学:从原子到生命》以生物学功能为主线,以生物大分子及其复合物的三维原子结构为中心,全面深刻地解析了重要生命活动过程的结构基础及由此阐发的分子机理,内容涵盖了从蛋白质、核酸、脂类到生物膜的基本结构信息及知识,从遗传信息DNA到RNA到蛋白质的传递,到基因产物蛋白质的产生与消亡,从各类生物信号转导、细胞运动、物质输运与相互作用,到免疫系统的结构生物学和病毒结构与功能,系统深入,内容丰富翔实,图文并茂,整合了迄今最新的研究成果和学科知识,展现了从生物大分子的原子结构到重要生命活动的内在联系和基本原理。《结构生物学:从原子到生命》适合对结构生物学感兴趣的各学科、各层次的科研工作者参考,特别适合从事与结构生物学相关领域研究的高年级本科生和研究生使用。

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